Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TUBB3Q13509 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TUBB3Q13509 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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