Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XRCC4Q13426 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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