Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE3BQ13370 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms