Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUSP4Q13115 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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