Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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