Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM32Q13049 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM32Q13049 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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