Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
STRN3Q13033 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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