Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms