Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TROQ12816 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TROQ12816 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TROQ12816 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TROQ12816 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TROQ12816 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TROQ12816 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TROQ12816 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TROQ12816 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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