Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms