Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAAP100Q0VG06 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAAP100Q0VG06 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms