Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC8Q09428 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC8Q09428 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms