Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms