Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCNT1Q02742 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCNT1Q02742 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms