Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BDH1Q02338 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms