Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms