Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms