Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SKP1P63208 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP1P63208 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms