Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P63132 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms