Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCE1P61221 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCE1P61221 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms