Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FAM3BP58499 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM3BP58499 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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