Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CABP4P57796 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms