Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms