Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA1P56159 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms