Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHB3P54753 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms