Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COPAP53621 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPAP53621 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPAP53621 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COPAP53621 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPAP53621 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms