Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC25A1P53007 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms