Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DAP3P51398 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms