Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GSK3BP49841 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms