Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP153P49790 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP153P49790 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP153P49790 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NUP153P49790 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NUP153P49790 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP153P49790 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP153P49790 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP153P49790 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP153P49790 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms