Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POU3F4P49335 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms