Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM4P49221 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM4P49221 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms