Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEDD4P46934 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEDD4P46934 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms