Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDIT3P35638 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms