Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA7P31268 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA7P31268 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms