Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD40LGP29965 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms