Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRABP1P29762 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms