Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5AP29375 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5AP29375 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms