Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB9P28065 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB9P28065 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms