Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF1P22415 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF1P22415 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF1P22415 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF1P22415 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF1P22415 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF1P22415 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USF1P22415 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USF1P22415 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USF1P22415 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms