Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMY2BP19961 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMY2BP19961 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMY2BP19961 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMY2BP19961 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMY2BP19961 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AMY2BP19961 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AMY2BP19961 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AMY2BP19961 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMY2BP19961 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMY2BP19961 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms