Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms