Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATF3P18847 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF3P18847 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms