Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTPS1P17812 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms