Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME1P15531 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME1P15531 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME1P15531 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME1P15531 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME1P15531 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms