Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHGAP10645 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHGAP10645 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHGAP10645 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHGAP10645 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHGAP10645 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHGAP10645 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms