Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RGPD2P0DJD1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms