Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms