Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCG5P05408 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCG5P05408 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCG5P05408 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms