Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms